دعم ومتابعة الأداء المؤسسي في مدارس التعليم الخاص وفق مؤشرات الأداء المؤسسية (غير التعليمية) لها، وتقارير التقويم والاعتماد المدرسي الواردة من هيئة تقويم التعليم والتدريب في الجوانب المؤسسية غير التعليمية. 

متابعة التزام مدارس التعليم الخاص بالضوابط والسياسات الصادرة من وكالة التعليم الخاص في الجوانب المؤسسية غير التعليمية وشروط الترخيص. 

استقبال الملاحظات والشكاوى الواردة من المستفيدين (الطلاب، أولياء الأمور، وغيرهم) على مدارس التعليم ضمن اختصاص إدارة التعليم العامة، وتوثيقها والرفع بها للقطاعات ذات الاختصاص، وفرض العقوبات بشأنها وفق لائحة الجزاءات والمخالفات المعتمدة لذلك. 

اقتراح التحسينات اللازمة للأنظمة واللوائح والتعليمات والإجراءات الخاصة في مدارس التعليم الخاص، ورفعها للقطاعات ذات العلاقة. 

 تحديد الاحتياج من التعليم الخاص قبل الجامعي في إدارة التعليم العامة وإدارات التعليم بالمحافظات التابعة لها. 

متابعة تنفيذ معايير الإعانة السنوية والقسائم التعليمية وإعداد قوائم بمؤسسات التعليم الخاص المرخصة والرفع بها إلى قطاع الاختصاص. 

معالجة الشكاوى والقضايا فيما يتعلق بمدارس التعليم الخاص. 

الرفع بطلبات التراخيص. 

متابعة شهادات الدفاع المدني وشهادات بلدي. 

رفع تقارير الجاهزية. 

تنفيذ إجراءات الاعانة السنوية للمدارس الخاصة.